Independencia, reforma y porfiriato...

Durante el Siglo XIX, Xalatlaco vuelve a tomar parte activa en las tres épocas históricas.
Desde el inicio de la Independencia encabezada por el padre de la patria Don Miguel Hidalgo, en el pueblo de Dolores, éste emprende recorridos por el territorio mexicano enarbolando la bandera de la libertad. Del pueblo de Dolores se traslada a San Miguel el Grande, Guanajuato. Ixtlahuaca, Toluca, Tianguistenco, Xalatlaco y de aquí al Monte de las Cruces. Este recorrido de luchas armadas se conoce en la historia, como "€œLa ruta de Hidalgo"€.
La Batalla de Xalatlaco (1861), con la cual termina la guerra de Reforma: Como consecuencia del centralismo y dictadura del presidente Antonio López de Santa Ana, que hundió al pueblo mexicano en terrible pobreza, ... surge la Revolución de Ayutla en 1854, encabezada por el general Juan Alvarez cuya finalidad, era acabar con la tiranía santanísta. La Revolución se extiende por todo el país y logra su objetivo en 1856. Santana es derrotado y la Revolución de Ayutla plasma su lucha en la Constitución Política de 1857.
Una junta de revolucionarios reunidos en Cuernavaca, de todo el país, nombra como presidente de la República al general Ignacio Comonfort, encargado de la aplicación de la nueva Constitución. Los reductos de Santana, encabezados por Félix Zuloaga, Miguel Miramón, Leonardo Marqués, Tomás Mejía y una decena de arzobispos y obispos desacatan la nueva Constitución, sacan a Comonfort e imponen a Félix Zuloaga como presidente de los conservadores, cuyo lema: "€œReligión y Fueros"€, en contra de liberales, encabezados por Juárez, con su lema "€œConstitución y Reforma"€ y se inicia una larga guerra llamada "€œGuerra de Reforma"€ para hacer respetar las leyes del 57 defendidas por el presidente Juárez.
Las fuerzas conservadoras disponen de dinero, armamento mejor y como consecuencia, ganan batalla tras batalla, hasta que el general republicano Dn. Jesús González Ortega, gana tres batallas fundamentales: La de Silao y la de Calpulalpan en 1860 y para concluir, la "€œBatalla de Xalatlaco"€, el 13 de agosto de 1861. Aquí termina la Guerra de Reforma,  también conocida como la guerra de los tres años. El resultado: más de 3,000 muertos de las fuerzas conservadoras y más de cien de las fuerzas juáristas. Aquí el héroe más importante de la batalla, el coronel Porfirio Díaz. Todo el armamento, bestias y demás pertrechos de guerra fueron abandonados por el enemigo. Las torres y pórtico del templo parroquial fueron destruidos.
Erección del municipio (octubre 10 de 1872)
Una vez consumada la Independencia de México, la mayoría de los pueblos de más de mil habitantes se consideraron municipio, sin embargo, a raíz de la creación del Estado de México, el 2 de marzo de 1824, el primer gobernador se vió obligado a reducir el número de municipios por problemas administrativos y la lejanía de los mismos. Por lo tanto, el Congreso del Estado, expidió un decreto de 9 de febrero de 1825, por medio del cual dispuso que sólo los municipios con más de cuatro mil habitantes mantendrían la categoría, en consecuencia, en ese entonces, Xalatlaco no tenía los cuatro mil habitantes y tuvo que pasar a depender del municipio de Tianguistenco, hasta que en 1872, el 10 de octubre, el Congreso del Estado, eleva a Xalatlaco a la categoría de municipio.
El Porfiriato
Durante la prolongada dictadura porfirista, Xalatlaco, pueblo campesino, sufre los embates e injusticias de la dictadura con el cacique Dolores Reynoso, seis veces presidente municipal.
Revolución Mexicana
Como pueblo eminentemente campesino, Xalatlaco se levantó en armas para apoyar al general Emiliano Zapata que peleaba por el bien de los campesinos que eran víctimas de la dictadura porfirista.
A pesar de haberse iniciado la Revolución Mexicana el 20 de noviembre de 1910, fue hasta el 10 de abril de 1911 cuando el maderista, Joaquín Miranda, incendió el histórico archivo del municipio. Por zapatista, Xalatlaco fue reprimido, primero por Huerta y después por Carranza. 
En 1914, el jóven Gustavo Baz Prada llegó semidesnudo al curato del templo parroquial. El cura le obsequió ropa y zapatos para que se cubriera. Horas antes había participado en un combate contra huertistas.
El 11 de diciembre de 1915, con toda la barbarie, fuerzas carrancistas incendiaron el pueblo de Xalatlaco. La coronela zapatista Margarita Miranda Ordónez fue la heroína ante esta tragedia. Posteriormente, el 7 de mayo de 1916, los carrancistas obligan a los sobrevivientes de Xalatlaco a abandonar el pueblo para refugiarse en poblados del plan de Toluca. El 3 de febrero de 1918, fueron reconcentrados los sobrevivientes a su pueblo Xalatlaco.
Cientos de hombres y mujeres xalatlaquenses participaron con las armas al lado de Zapata, por los generales Genovevo de la O, Francisco B. Pacheco, Gustavo Baz Prada, etc. Entre los cuales también se encontraban: Atanacio Fidel Vargas Briceño, Casiano Ordónez, Lorenzo López (capitanes), Margarita Miranda Ordónez, coronela; el general Regino Vega Laudinos, Corl. Pedro Negrete, Benito Muciño, Anastasio Luciano, los hermanos Luis José y  Pascasio Fernández, Pedro Cortés, Pedro Téllez, Cruz Ordoñez Villanueva, la capitana Apolonia Cervantes.